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NGS(次世代シーケンス)の今後の発展ポイント

2005年頃にNGS(次世代シーケンス)技術が登場してから、NGSはコストや性能、また利用される分野など様々ポイントで進化してきました。本記事では2023年末時点での、今後の発展ポイントを端的に紹介します。 ショートリードシーケンサー 現在...
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NGS(次世代シーケンス)実験の評価:解析編

NGS(次世代シーケンス)実験では、結果を取得するまで、サンプルの抽出からライブラリー調製、NGSによるランとその解析など、多くの工程が存在します。 本記事ではNGS実験の工程や結果に問題がないか、その評価と判断を行うポイントに関して、解析...
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NGS(次世代シーケンス)実験の評価:シーケンス編

NGS(次世代シーケンス)実験では、結果を取得するまで、サンプルの抽出からライブラリー調製、NGSによるランとその解析など、多くの工程が存在します。 本記事ではNGS実験工程のうち、シーケンス自体の評価と判断を行うポイントに関して紹介します...
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NGS(次世代シーケンス)実験の評価:ライブラリー調製編

NGS(次世代シーケンス)実験では、結果を取得するまで、サンプルの抽出からライブラリー調製、NGSによるランとその解析など、多くの工程が存在します。 本記事ではNGS実験工程のうち、ライブラリー調製の評価と判断を行うポイントに関して、紹介し...
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NGS(次世代シーケンス)解析のおおまかな流れ

本記事ではNGS(次世代シーケンス)実験を勉強中、特にwet研究者の方向けに、NGS解析のおおまかな流れをご紹介します。 NGS(次世代シーケンス)では実験結果を取得するまで、wet作業と呼ばれるシーケンスを行うまでのサンプル処理やシーケン...
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マルチオミクス解析とNGS(次世代シーケンス)

オミクス解析とは、マルチオミクス解析とは オミクス(Omics)解析は各領域を網羅的に研究することです。下記のような分野があり、分野 + omicsと表記されます。 ゲノミクス(Genomics = genome + omics) 生物のゲ...
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NGS(次世代シーケンス)におけるリード数とは

下記の記事でリード数とカバレッジの違いに関して簡単に説明しましたが、本記事ではNGS(次世代シーケンス)におけるリード数に関して、より詳細に解説します。 上記の記事でも解説しましたが、NGSにおけるリード数は、文字通りリードの数となります。...
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NGS(次世代シーケンス)におけるカバレッジとは

下記の記事でリード数とカバレッジの違いに関して簡単に説明しましたが、本記事ではNGS(次世代シーケンス)におけるカバレッジに関して、より詳細に解説します。 上記の記事でも解説しましたが、NGSにおけるカバレッジは、あるポジションや領域でリー...
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ゲノム編集技術とNGS(次世代シーケンス)

ゲノム編集とはDNA配列の特定の箇所を削除、追加、修正することで、目的とする遺伝子の働きをなくしたり、変えたりすることが可能な技術です。 ゲノム編集の技術自体は昔から存在していましたが、時間がかかる、配列が変わることが稀、ターゲットに出来る...
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RNA-SeqにおけるrRNAの除去方法(rRNA depletionとPoly(A) selection/enrichmentの比較)

RNA-SeqによりRNA配列を解析したいと考えても、実際のRNAには様々な種類が存在し、異なる割合で存在します。特にヒトなどの真核生物では、rRNA(リボソームRNA)は全RNA中の80%以上存在するため、予めrRNAを除去しておかないと...